人助けの結果、傷害の罪を着せられ、東京の高校・秀尽学園に転入することになった来栖暁。根も葉もない噂によって孤立する暁は、偶然出会った素行不良な少年・坂本竜司とともに、パレスと呼ばれる謎の城に迷い込んでしまう。そこでは秀尽高校の生徒達が、王を名乗る教師・鴨志田卓によって拷問を受けていた!!鴨志田に捕まった暁と竜司は、反逆の意志の力「ペルソナ」を覚醒し、なんとか危機を脱する。そして、暁と竜司はパレスと現実の相関関係を知り、手に入れた「ペルソナ」を武器に、鴨志田の改心を目論むが、鴨志田の悪行により学校ではさらなる悲劇が起こり――!!大ヒットゲーム『ペルソナ５』の完全コミカライズがついに登場！！